雷蒙德氏棉基因组顺式调控元件的组蛋白修饰特征分析开题报告

 2023-09-08 09:14:55

1. 研究目的与意义

研究的现状及发展趋势:

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2. 研究内容和问题

2.1研究内容

(1)雷蒙德氏棉叶片组织的H3K4me3、H3K9ac、H3K27ac和H3K27me3图谱构建

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3. 设计方案和技术路线

3.1研究方法

(1)雷蒙德氏棉叶片组织的ChIP-seq 数据分析

收集雷蒙德氏棉叶片组织,使用H3K4me3、H3K9ac、H3K27ac和H3K27me3的抗体开展ChIP-seq 实验,构建ChIP-seq文库,并进行高通量测序。通过 Bowtie2 和 MACS2 软件对数据进行比对和组蛋白修饰位点鉴定分析,构建组蛋白修饰图谱。

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4. 研究的条件和基础

条件:

本人具备一定的实验技能,能够完成有关的实验操作,初步掌握分析DNase-seq数据,ChIP-seq数据以及基因组测序数据的技能,能够在导师指导下完成本研究有关的数据分析工作。

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