混合神经网络模型学习并预测信息素诱导型启动子强度开题报告

 2023-04-18 09:34:16

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

文 献 综 述引言启动子对酿酒酵母(S. cerevisiae)的遗传回路和代谢途径进行微调,在调控基因表达中起着至关重要的作用。

然而,酿酒酵母天然启动子存在一些局限性,阻碍了其在代谢工程中的应用。

这些限制包括被充分表征的启动子数量不足、动态范围较差以及对内源调控的正交性不足。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

一、研究内容启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板 DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。

启动子序列的活性对转录起重要作用。

本项目使用Python语言,基于深度神经网络学习,构建CNN与RNN算法的混合模型,并用信息素诱导得到的启动子序列和强度数据库训练模型,来寻找启动子序列与强度之间的内在关系,并基于该模型对未知强度的给定启动子序列进行强度预测。

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